По сериалу «Заповедный спецназ», в Байкальском национальном парке обитает множество уникальных видов животных, проживающих там под полной защитой государства. Здесь заповедная зона, запрещающая любую охотничью деятельность под страхом уголовного наказания. Но однажды начинают происходить случаи наглого браконьерства, наносившие тяжелый ущерб местной природе. Источниками проблем стали богатые чиновники и нахальные олигархи, считающие себя хозяевами жизни, неподсудными законам обычных людей. Регулярно приезжая поохотиться в столь прекрасные места, они легко откупаются от претензий полицейских, получая возможность безнаказанно уничтожать природные шедевры.
Вскоре против беспредела власть имущих выступает группа природных инспекторов «Рысь» под руководством опытного военного Юрия Тарханова. Раньше он был бойцом спецназа, регулярно участвовавшим в боевых операциях против вооруженных противников. За годы службы ему часто приходилось сталкиваться с опаснейшими бандитами страны, готовыми убивать всех вокруг ради удовольствия. Но здесь преступников покрывают чины из правительства, вынуждая сурового вояку искать особые пути решения таких сложных ситуаций с могущественными врагами.