Главная идея сериала «Операция Валькирия» заключается в описании исторического факта. Однажды в 1947 году по дороге на Кавказ Сталин посетил Ливадию, где остался на одну ночь. На следующий же день его наскоро забирают из Ялты, и отвозят в Сухуми на боевом корабле.
Действия сериала начинают разворачиваться еще в 1944 году. В ту пору немецкие войска отступают из ранее оккупированных ими территорий Крыма. Тогда же сотрудники абвера (немецкой разведки) проводят одну строго засекреченную операцию. Они пытаются внедрить шпионскую сеть на места, откуда они уходят. Смысл всего этого – диверсии в тылу СССР.
Чуть позже события переносят зрителя в 1947 год. Тогда на территории лагеря «Артек», и санатория, находящегося рядом, проводится операция «Валькирия». Ее целью должно стать массовое отравление маленьких детей, а так же ликвидация самого генералиссимуса Сталина.
Диверсанты отравляют еду. Всю поступающую продукцию проверяет группа солдат под прикрытием, после чего направляет ее в лагерь. Вскоре нацисты будут удивлены тем фактом, что дети не отравились. Они пока еще не знают, что это место хорошо охраняется чекистами. Осталось узнать лишь одно – кто стоит за всем этим?